ISO的组织机构包括理事会、ISO中央秘书处、全体大会、政策制定委员会、特别顾问组、技术管理局、技术顾问组、标准样品委员会、技术委员会等。理事会是ISO常务领导机构，在全体成员大会闭幕期间具体行使职权。ISO的日常行政事务由中央秘书处负责，截至2006年底，中央秘书处在日内瓦有153名全职员工。各技术委员会可设若干个分技术委员会。