我国食品卫生从20世纪80年代初到90年代中期，经历了一个迅速提高期，90年代中期后进入了稳步提高期。全国食品卫生抽检结果表明，我国食品卫生抽检合格率在逐年提高。《食品卫生法（试行）》前的1982年，我国食品卫生监测总体合格率为61.5％；《食品卫生法》实施后，1994年、2000年和2002年，食品卫生监测总体合格率分别达到了82.3％、88.9％和93.4％。在2003、2004两年，全国食品卫生监测总体合格率继续保持稳步提高，在2003年一季度还达到97.l％。

    专家认为，以上数据说明我国食品卫生总体状况在向好的方向发展，但要使食品卫生水平再上一个新台阶，接近和达到世界发达国家水平，食品卫生监督管理模式及干预政策则需要进行新的改革。

    当前我国食品安全存在的主要问题概括为以下五个方面：

    一是微生物引起的食源性疾病是影响食品安全的主要因素、我国这方面的问题多集中在粮食贮存运输环节、卫生管理薄弱的食品加工点和一些餐饮摊点。

    二是种植业和养殖业的源头污染对食品安全的威胁。其中，农药和兽药对食品源头的污染是主要问题，表现为经营者违法使用高毒农药如剧毒鼠药、高毒高残留农药；违法使用抗生素、激素等兽药；违法使用瘦肉精等饲料添加剂；贸易范围扩大和人口流动使动物疫病的防治面临新问题等。

    三是食品生产经营中严重使用不合格原料生产加工食品的问题。如使用病死畜禽肉、过期产品、发霉变质原料等，非法添加非食用成分，使用甲醛泡制海产品，火锅中添加罂粟壳，用硫磺熏制白馒头，保健食品里添加违禁药物，非法、超范围、超用量使用防腐剂、色素、过氧化苯甲酸钠等食品添加剂。

    四是食品工业应用新原料、新工艺带来的食品安全问题。如利用中草药、转基因食品等新资源；化学合成添加剂等新的食品添加剂；食品新型包装材料从孔树脂吸附纯化、食品辐照等新的食品加工工艺。研究人员对这些新工艺在食品加工中的性能还未全面了解和掌握，因此可能带来新的食品安全问题。

    五是环境污染对食品安全构成的严重威胁，目前比较突出的主要是二恶英和有机氯的污染问题。