“十二五”期间，水专项将更加注重流域统筹，更直接地和流域水质改善目标挂钩。同时，更加注重成果集成，从单项技术突破向整装成套技术集成转变。水专项还将重点突破“减负修复”关键技术、饮用水安全保障技术和流域水环境监控预警“业务化”运行技术。

　　作为国家科技重大专项之一，水专项涵盖6个主题、33个项目、总计238个课题，实施周期长达13年。 “十一五”期间总投资112.66亿元，其中中央财政投入45.43亿元，是新中国成立以来环境领域最大的科研项目。据介绍，在全国上千家单位、上万名科技工作者的不懈努力之下，水专项不仅突破了一批“控源减排”关键技术，支撑主要污染物减排任务超额完成，同时，综合集成示范多项关键技术，增强改善重点流域水环境质量的信心。不仅如此，还研发出一批关键设备和成套装备，带动节能环保战略性新兴产业加快发展。